شبیه سازی زنجیره های بیولوژیکی نادر با استفاده از mcmcmc

پایان نامه
چکیده

یکی از مهمترین مسایل در علم ژنتیک مقایسه زنجیره های بیولوژیک مانند dna و پروتئین ها می باشد. با توجه به نتیجه مقایسه می توان شباهت زنجیره ها را مشخص کرد. تشابه دو زنجیره نشان دهنده این مطلب است که پدر(نقطه تکامل) هر دو زنجیره یکسان می باشد. بنابراین این شباهت ها منتج به طبقه بندی این زنجیره در خانواده و زیر خانواده ها می گردد. این کار به پیش بینی عملکرد ساختمان ثانویه و همچنین بدست آوردن شجره یک پروتئین کمک می کند. این همانندی دو زنجیره که مفهوم کیفی است را کمی نموده (رتبه محلی نامیده می شود) و مرحله بعدی بررسی معنی داری این کمیت می باشد. حاصل مطالعات فراوان تجربی و تئوریک که در این زمینه انجام شده نشان داد که می توان معنی داری رتبه محلی را از طریق توزیع گامبل بدست آورد. از آنجایی که این رتبه های بزرگ بسیار کمیاب هستند و احتمال تولید آنها بسیار کوچک می باشد لذا از طریق نمونه گیری های معمولی نمی توان به آنها دست یافت. اخیرا برای حل این مشکل روش نمونه گیری از پیشامدهای نادر پیشنهاد شده است که این ایده بر اساس روشی در فیزیک آماری می باشد

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

مدل سازی و شبیه سازی دینامیک سه بعدی حرکت نانوذرات بیولوژیکی با استفاده از نانوربات afm

در نانومنیپولیشن با استفاده از میکروسکوپ نیروی اتمی، جهت جابه جایی میکرو/نانوذرات مختلف، محاسبه ی دقیق نیرو و زمان بحرانی منیپولیشن به منظور عدم آسیب دیدن و جابه جایی دقیق میکرو/نانوذرات هدف، امری ضروری می باشد. برای رسیدن به این هدف نیاز به مدل سازی دقیق سینماتیک و دینامیک نانومنیپولیشن می باشد که پیش از این به صورت دوبعدی صورت پذیرفته است. در این مقاله به مدل سازی و شبیه سازی دینامیک سه بعدی ...

متن کامل

مدیریت بهینه عملیات بارگیری فرآورده های نفتی با استفاده از بهینه سازی شبیه سازی

سیستم ذخیره سازی، بارگیری و انتقال فرآورده های نفتی مهم ترین بخش زنجیره تامین فرآورده های نفتی را تشکیل می دهد. مدیریت این سیستم، نقش به سزایی در عملکرد زنجیره تامین فرآورده های نفتی دارد. به علت گستردگی عملیات انبارهای نفتی، استفاده از روش های علمی و بهینه سازی به جای روش های سنتی برای استفاده بهینه از منابع موجود انبارهای ذخیره سوخت و کاهش هزینه های سیستم ضروری به نظر می رسد. در این مطالعه،...

متن کامل

تخمین عدم قطعیت مدل شبیه سازی سیلاب HEC-HMS با استفاده از الگوریتم مونت کارلو زنجیره مارکوف

There are some parameters in hydrologic models that cannot be measured directly. Estimation of hydrologic model parameters by various approaches and different optimization algorithms are generally error-prone, and therefore, uncertainty analysis is necessary. In this study we used DREAM-ZS, Differential Evolution Adaptive Metropolis, to investigate uncertainties of hydrologic model (HEC-HMS) pa...

متن کامل

مطالعه برخی از خواص نانوکامپوزیت های پایه پلیمری با استفاده از شبیه سازی دینامیکی مولکولی

درک سازوکار رفتار نانوکامپوزیت های پایه پلیمری، نیازمند بررسی در سطح مولکولی است. این نوع بررسی با استفاده از فنون تجربی، چالش برانگیز است. شبی هسازی دینامیک مولکولی به عنوان یکی از معمول ترین روش های محاسباتی، م یتواند نقش مهمی در کمک به توجیه و تفسیر نتایج تجربی بازی کند. در کار حاضر، برخی از خواص شیمی فیزیکی نانوکامپوزیت های پایه پلیمری حاوی نانولوله های کربنی، بورونیتریدی و استخلاف دار، پلی...

متن کامل

استخراج پارامتر های پارچه از تصویر شبیه سازی شده با استفاده از روش الگوریتم ژنتیک

تشخیص صحیح طرح رنگ و بافت در پارچه با نخ های رنگی از مهم ترین نیازهای طراحان و تولید کنندگان پارچه است. این مهم، امری زمان بر است و نیاز به دقت زیادی دارد. در این راستا، پردازش تصویر با استفاده از الگوریتم های فرا ابتکاری می تواند روش مفیدی را برای دستیابی به این هدف ارائه دهد. در این پژوهش، با کاربرد روشی جدید بر پایه الگوریتم ژنتیک، پارامترهای طرح رنگ، تعداد تکرار آن و طرح بافت به طور هم زمان...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران

کلمات کلیدی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023